Os auditores podem declarar impedimento nas situações que afetem o desempenho das suas atribuições.

Os auditores internos governamentais não podem prestar serviços de consultoria sobre operações que tenham avaliado anteriormente ou avaliar operações sobre as quais tenham prestado prévio serviço de consultoria.

Os auditores internos governamentais devem possuir conhecimentos suficientes sobre os principais riscos de fraude, sobre riscos e controles de tecnologia da informação e sobre as técnicas de auditoria baseadas em tecnologias disponíveis para a execução dos trabalhos.

A autonomia técnica refere-se à capacidade da Unidade de Auditoria Interna Governamental (UAIG) de desenvolver trabalhos de maneira parcial. Nesse sentido, a atividade de auditoria interna governamental deve ser realizada livre de interferências na determinação do escopo, na execução dos procedimentos, no julgamento profissional e na comunicação dos resultados.

Os auditores internos governamentais devem se abster de auditar operações específicas com as quais estiveram envolvidos nos últimos 24 meses, quer na condição de gestores, quer em decorrência de vínculos profissionais, comerciais, pessoais, familiares ou de outra natureza, admitindo-se, contudo, sua atuação nos casos em que o envolvimento anterior tenha ocorrido em atividades operacionais.