As farmácias e drogarias devem possuir, obrigatoriamente, ambientes para atividades administrativas, recebimento e armazenamento de produtos, dispensação de medicamentos, depósito de material de limpeza e sanitário, além de laboratório para processamento das amostras.

As superficies internas das instalações podem ser porosas, desde que sejam higienizadas diariamente e apresentem bom estado de conservação.

As instalações devem possuir superficies internas (piso, paredes e teto) lisas e impermeáveis, resistentes aos agentes sanitizantes e facilmente laváveis.

O depósito de material de limpeza é dispensável quando a farmácia utiliza exclusivamente produtos de limpeza de uso doméstico.

Assim que entregues, os materiais de limpeza utilizados na sanitização das farmácias devem ser analisados quanto à sua pureza antes de serem utilizados nos processos de limpeza da farmácia.