Recomenda-se que o paciente tome banho com clorexidina (antisséptico) na noite anterior e na manhã da cirurgia.

O uso de mupirocina 2% pomada com cotonetes nasais é eficaz na redução do transporte nasal de Staphylococcus aureus, diminuindo a incidência de infecções do sítio cirúrgico.

Antibioticoprofilaxia deve ser iniciada dentro de 1 hora (cefalosporinas) ou 2 horas (vancomicina) antes da cirurgia e continuadas por 24 a 48 horas, a depender da clínica do paciente.

A remoção de pelos deve ser realizada preferencialmente com lâminas de barbear na noite anterior à cirurgia.

As infecções profundas da ferida esternal (mediastinite) são raras (cerca de 1%), mas carregam uma mortalidade hospitalar significativa (cerca de 20%).