Alguns fármacos são citados como contraindicações absolutas ou relativas ao aleitamento, como, por exemplo, os antineoplásicos e radiofármacos.

No caso de abcesso mamário recomenda-se a interrupção temporária da amamentação até que ele tenha sido drenado e a antibioticoterapia iniciada. A amamentação deve ser mantida na mama sadia.

Acredita-se que os benefícios do leite materno para a criança superem os possíveis malefícios da exposição à nicotina via leite materno. Por isso, o cigarro não é uma contraindicação à amamentação.

Recomenda-se a interrupção da amamentação no caso de mãe portadora de hanseníase nos três primeiros meses de tratamento da doença.