Infecção exógena é a que se verifica a partir de microrganismos do próprio paciente, geralmente imunodeprimido.

Os agentes etiológicos mais comumente encontrados nos processos infecciosos são as bactérias. Entretanto, fungos, vírus ou protozoários, na dependência da infecção, do tipo e da gravidade da doença de base do paciente, assim como dos antibióticos usados previamente e do tempo de hospitalização, podem ser igualmente frequentes e graves.

Infecção inter-hospitalar é a que se transmite de paciente para paciente, geralmente pelas mãos da equipe de saúde.

As IRAS que são levadas de um hospital para outro, com a alta e subsequente internação do mesmo paciente em diferentes hospitais, são chamadas de infecção cruzada.