A urina pode apresentar cor marrom, decorrente do contato prolongado de hemácias presentes na urina ácida, por causa da oxidação da hemoglobina em metemoglobina.

Urinas de cor azul/verde podem ser decorrentes de infecção do trato urinário por espécies de Pseudomonas ou ingestão de determinados medicamentos, como a amitriptilina.

A urina alcalina de cor negra pode ser indicativo de alcaptonúria.

Amostras amarelo-alaranjadas ou âmbar sempre e somente ocorrem em função da presença em excesso do pigmento bilirrubina.

Derivados do fenol, encontrados em determinados medicamentos intravenosos, produzem urina verde quando oxidados.