As Fases do Tratamento envolvem o pré – tratamento: por sistema de gradeamento e desarenação (tipo gravimétrico).

O tratamento secundário é composto pelas seguintes unidades: Seletor Biológico e Câmara de disnitrificação. Porém as unidades Sistema de desidratação e Prensa desaguadora não fazem parte do tratamento secundário.

No tratamento secundário, a Câmara de disnitrificação é a primeira unidade do processo cuja função é misturar suavemente o esgoto bruto afluente com lodo ativado proveniente do processo de tratamento de aeração prolongada, evitando assim o desenvolvimento de micro-organismos indesejáveis ao tratamento.

No tratamento secundário no Seletor Biológico a mistura passa por uma câmara que, através de misturadores submersíveis, tem a função de reduzir o nitrato sob a ação de micro-organismos específicos.

No tratamento secundário os Tanques de aeração são do tipo gravimétrico, com removedor mecânico. A função desta unidade é reduzir a quantidade de água contida no lodo sedimentado nos decantadores.