A USE utiliza transdutores ultrassônicos de alta frequência incorporados à ponta de um endoscópio flexível.

As imagens ultrassônicas são obtidas da parede intestinal e dos órgãos adjacentes, dos vasos sanguíneos e dos linfonodos.

A USE permite estadiamento local pré-operatório mais preciso das neoplasias malignas do esôfago, do pâncreas e do reto, e detecta as metástases mais distantes.

A USE também é útil para o diagnóstico dos cálculos do ducto biliar, da doença da vesícula biliar, das lesões gastrintestinais submucosas e da pancreatite crônica.

A aspiração por agulha fina e as biopsias com agulha oca das massas e dos linfonodos no mediastino posterior, abdome, pâncreas, retroperitônio e pelve podem ser realizados sob a orientação da USE.