Segundo a Portaria nº 2.616/1998 — Diretrizes e normas para o controle de infecção hospitalar, o diagnóstico das infecções hospitalares deverá valorizar informações oriundas de:
I. Resultados de exames de laboratório, ressaltando-se os exames microbiológicos e a pesquisa de antígenos, anticorpos e métodos de visualização. II. Evidência clínica, derivada da observação direta do paciente ou da análise de seu prontuário.