Alguns pacientes com pneumonias comunitárias podem apresentar um curso clínico atípico, não se apresentando com o padrão bacteriano típico (febre alta, tosse produtiva de escarro purulento, dor torácica). De fato, esses pacientes frequentemente apresentam-se de forma mais frustra, com mais dores no corpo (mialgias), febre baixa e tosse pouco produtiva. Esses casos, chamados de pneumonia atípica, devem ser reconhecidos dada a provável origem causal por germes atípicos, muitas vezes exigindo esquema antibiótico particular. Duas pistas que falam a favor de pneumonia atípica por Legionella pneumophila incluem: