Na auditoria interna, o objetivo principal é atender às necessidades da administração. Na auditoria externa, o objetivo principal é atender às necessidades de terceiros no que diz respeito à fidedignidade das informações financeiras.

Na auditoria interna, o auditor deve ser independente em relação às pessoas cujo trabalho ele examina, porém subordinado às necessidades e desejos da alta administração. Na auditoria externa, o auditor deve ser independente em relação à administração, de fato e de atitude mental.

Na auditoria interna, a revisão das atividades da empresa é contínua. Na auditoria externa, o exame das informações comprobatórias das demonstrações financeiras é periódica, geralmente semestral ou anual.

Na auditoria interna, a revisão das operações e do controle interno é principalmente realizada para determinar a extensão do exame e a fidedignidade das demonstrações financeiras. Na auditoria externa, a revisão das operações e do controle interno é principalmente realizado para desenvolver aperfeiçoamento e para induzir o cumprimento de políticas e normas, sem estar restrita aos assuntos financeiros