A mais rica flora entre as savanas do mundo está no cerrado, com mais de 7.000 espécies, e, embora a riqueza de mamíferos seja relativamente pequena, as espécies de aves, peixes, répteis, anfíbios e insetos é grande, o que torna este bioma um dos hotspots para a conservação da biodiversidade mundial.

C. A. Klink e R. B. Machado. A conservação do cerrado brasileiro. Megadiversidade, v. 1, n. º 1, p. 147-155, 2005.

As principais ameaças à biodiversidade do cerrado são: a erosão dos solos, a degradação dos diversos tipos de vegetação presentes no bioma e a invasão biológica causada por gramíneas de origem africana.