A vagina se forma no terceiro mês de vida embrionária.

O seio urogenital dará origem a bexiga, uretra, glândulas vestibulares de Bartholin e glândulas uretrais e parauretrais de Skene.

O pseudo-hermafroditismo feminino ocorre em indivíduos 46XX, que possuem ovários e estruturais ductais internas femininas, porém com genitália externa ambígua ou com aspecto masculino.

A disgenesia gonadal pode ocorrer em diversas alterações, sendo a mais comum no feto feminino, o cariótico 45X0 (síndrome de Turner).

O hermafroditismo é uma condição rara onde há presença de ambas as gônadas e genitália ambígua em todos os casos.