As bactérias e os vírus são inativados no processo de desinfecção.

Cistos e oocistos de protozoários são mais resistentes à desinfecção que as bactérias.

Alguns protozoários e helmintos podem ser removidos por meio da filtração.

Os vírus são os micro-organismos mais resistentes à desinfecção, superando os helmintos e protozoários.

Há maiores dificuldades em remover o protozoário Giardia por processos de tratamento de água, comparado a outros organismos patogênicos.