Os estudos e levantamentos sobre a fauna aquática devem considerar a necessidade de classificar os cursos d’água da bacia hidrográfica apenas com base na presença de peixes adultos, desconsiderando aspectos específicos como áreas de desova de espécies migratórias e distribuição de ovos e larvas.

Quando o trecho a montante do reservatório é extenso, tem locais de desova inalterados e apresenta amplas áreas naturalmente alagáveis, espera-se que as espécies migradoras retidas a montante da represa mantenham seus estoques, porém com perdas na diversidade genética ao longo do tempo.

Na Amazônia, no que conerne à motivação para deslocamentos, foram identificados apenas dois tipos de migração de peixes: as laterais, ligadas à reprodução, e as tróficas, que ocorrem em direção à várzea alagada.

Os grandes peixes migradores de água doce utilizam os mesmos habitats, no mesmo tempo e espaço, para reprodução, crescimento e alimentação durante seus diferentes estágios de vida.

Em sistemas naturais onde as comunidades de peixes presentes são resultantes de um longo processo evolutivo, as espécies apresentam ciclos de vida independentes da dinâmica do regime hidrológico.