Os padrões agroecológicos constituem um arcabouço de práticas necessárias, permitidas, desejadas ou proibidas, que deverão ser avaliadas para a emissão da certificação.

Somente órgãos estatais nacionais podem ser certificadores de produtos de origem agroecológica.

Os padrões a serem obedecidos por esse tipo de certificação não são dinâmicos, ou seja, uma vez determinados, dificilmente serão revisados.

A certificação agroecológica está relacionada ao produto e não ao sistema de produção ou ao produtor.