Dentre os principais problemas ambientais enfrentados pelo bioma amazônico, destacam desmatamento, queimadas, agropastoreio, garimpagem e biopirataria. Acerca desta última ameaça — que envolve exploração, manipulação e exportação de recursos biológicos com fins comerciais, ao arrepio das normas estipuladas pela Convenção Sobre Diversidade Biológica (ONU, 1992) —, pode-se dizer que a biopirataria gera os seguintes efeitos adversos:
1. Extinção de espécies.
2. Desequilíbrio ecológico.
3. Prejuízos socioeconômicos.
4. Recrudescência da pesquisa científica e tecnológica nacional.
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