Pelo fato de as lesões de endometriose conterem receptores para estrogênio, progesterona e androgênio, a doença é hormônio dependente. Enquanto o estrogênio estimula o crescimento dos focos de endometriose, os androgênios e a progesterona induzem à atrofia

O tratamento expectante é recomendado como abordagem inicial nas pacientes férteis com doença profunda e sintomas pesados ou em mulheres distantes da menopausa.

No tratamento hormonal, uma estratégia básica no tratamento desta doença é aumentar os níveis de estrogênio ou diminuir a ação de androgênio e progesterona.

O tratamento cirúrgico deve desconsiderar a idade da paciente, seu desejo reprodutivo e sua queixa principal, se dor ou infertilidade.