As anomalias do aparelho faríngeo, também chamadas de branquial, apresentam-se principalmente na região central do pescoço, podendo se apresentar na forma de cisto ou fístula.

O cisto de ducto tireoglosso é revestido por epitélio respiratório ou escamoso estratificado não queratinizado, apresentando-se clinicamente na maioria dos casos como tumoração próximo ao osso hioide.

O linfangioma cervical pode ser classificado como capilares, cavernosos e císticos. Apresentando-se no pescoço em mais de 90% dos casos sob a forma especial de higroma cístico.

A tireoide ectópica localiza-se principalmente na base da língua, manifestando-se clinicamente com disfagia, alteração da voz e em alguns casos com dispneia.

O torcicolo congênito é caracterizado por encurtamento do músculo esternocleidomastoídeo, provocando rotação contralateral da face e do mento.