A presença de lactobacilos na vagina é considerada uma colonização fisiológica que serve de proteção natural, pois essas bactérias produzem ácido láctico, peróxido de hidrogênio e agentes bactericidas que criam um ambiente desfavorável à presença de bactérias anaeróbias como as Peptostreptococcus e as Gardnerella vaginalis.