De acordo com estudos do Instituto Trata Brasil, 55% do esgoto doméstico originado no Brasil são despejados diretamente na natureza, o que equivale a 5,2 bilhões de metros cúbicos por ano ou quase 6 mil piscinas olímpicas de esgoto por dia. No esgoto doméstico se encontram diversos microorganismos, sendo que os principais são as bactérias, os fungos, os protozoários, os vírus e as algas. Deste grupo, os microrganismos que são responsáveis pela decomposição e estabilização da matéria orgânica, tanto na natureza como nas estações de tratamento, são: