O CMH, ou MHC, é codificado pelos antígenos leucocitários humanos (ALH).

O CMH de classe II encontra-se presente em todas as células nucleadas e plaquetas.

O ALH-B27, observado em 90% dos pacientes com espondilite anquilosante, e em cerca de 7% dos pacientes com lombalgia mecânica, está presente na maioria daqueles com manifestações cardíacas e está sendo usado como novo critério para o diagnóstico de espondilite anquilosante.

Os genes do comossomo 6 são os únicos implicados nas doenças reumáticas, pois são os que codificam o CMH de classe II.

O risco relativo da associação de determinados alelos do antígeno leucocitário humano (ALH) e o desenvolvimento das doenças reumáticas é, em geral, menor que 10. A exceção encontra-se na espondilite anquilosante, em que a presença do ALH-B27 confere um risco relativo próximo de 100.