A perda de água em plantios anuais é compensada pela irrigação e em plantios perenes esta compensação não é necessária.

A formação de raízes profundas em culturas perenes é uma vantagem em relação à fertilidade do solo, mas um problema enfrentado pelos agricultores com relação à substituição de uma cultura por outra.

Em cultivos anuais, o uso de maquinário, pesticidas e fertilizantes é pouco intenso quando comparado às culturas perenes.

Cultivos de espécies anuais promovem uma maior fixação de carbono do que cultivos de espécies perenes.