Os pulmões representam o sítio de estabelecimento mais comum da sepse neonatal.

Pneumonias virais não são frequentes no período neonatal, com exceção de surtos epidêmicos de vírus sincicial respiratório ou adenovírus, e em casos do grupo TORCH.

O estreptococo do grupo B é o patógeno mais importante na pneumonia neonatal, e os prematuros representam cerca de 1/3 dos bebês que apresentam bacteremia por esse agente.

Em alguns casos, os sintomas respiratórios podem ser discretos, predominando quadro neurológico de intensidade variável, instabilidade térmica, apneia, distensão abdominal ou icterícia.

A infecção ascendente do trato genital materno depende da rotura de membranas, principalmente quando ocorrer por mais de 18 horas.