A reconstrução tridimensional de imagens de alta resolução não está limitada a microscópios de média e alta tensão de aceleração de elétrons. Por meio da utilização de uma metodologia que pode ser utilizada em modelos mais comuns de microscópio eletrônico de transmissão, pode-se obter uma reconstrução tridimensional da imagem com auxílio de um software dedicado a essa tarefa. Simplificadamente, as etapas que compõem essa metodologia são:
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