Na infecção primária, as espécies predominantes de microrganismos são gram-positivos (estritos ou facultativos), espécies que conseguem sobreviver à insuficiência de nutrientes e se adaptam a condições ambientais inóspitas.

A infecção secundária ocorre concomitantemente à necrose do tecido pulpar.

A carga bacteriana e sua diversidade são maiores no grupo da infecção primária, porém são facilmente eliminadas pela adequada instrumentação dos canais radiculares, sobremaneira nos períodos mais curtos desde a ocorrência da necrose pulpar.

A infecção secundária consiste em infecções polimicrobianas dominadas por bactérias anaeróbicas gram-negativas e gram-positivas.