A técnica de eletroforese de hemoglobinas consiste em preparar o hemolisado de glóbulos do paciente e depositar pequena quantidade no meio que será empregado para a corrida eletroforética no lado do polo negativo.

A eletroforese de hemoglobina baseia-se no fato de que a hemoglobina tem carga positiva em meio alcalino, migrando no sistema eletroforético para o polo positivo.

A velocidade de migração das hemoglobinas é proporcional à sua carga, a qual depende da quantidade de aminoácidos presentes.

Os métodos mais utilizados para eletroforese empregam o papel de filtro, acetato de celulose, o gel de Agar, o gel de amido e o gel de acrilamide.