O critério de seleção dos medicamentos deve ser realizado com base em princípios fisiopatogênicos, raciocínio lógico, observação pessoal e intuição.

Para a programação de medicamentos, podem ser empregadas ferramentas como a análise XYZ, que busca classificar os medicamentos baseados no impacto de uma eventual falta do item no tratamento correto ao paciente.

Na comprovação da existência de um único produtor do medicamento no mercado, mesmo com vários distribuidores, o método de licitação pode ser dispensado para a aquisição dos medicamentos.

A área de estoque deve ser bem arejada para garantir a integridade e a estabilidade dos produtos, assim, a presença de janelas nas centrais de armazenamento é muito importante.