O cancro do eucalipto, que é causado pelo fungo Cryphonectria cubensis (Bruner) Hodges (anam. Endothiella sp.), afeta somente as plantas na fase de germinação (pré-emergência). Esse fungo se desenvolve melhor em temperaturas entre 28 e 32 ºC.

O mofo cinzento, causado pelo Botrytis cinerea Pers., ataca canteiros com alta densidade de mudas e em condições de umidade e temperaturas elevadas. Os sintomas da doença começam com manchas cloróticas que evoluem para pústulas de cor cinza, e ocorrem inicialmente em tecidos jovens de folhas.

O oídio é facilmente disseminado pelo contato entre plantas doentes e sadias, vento e respingos de chuva ou irrigação. Ocorre com mais frequência em eucaliptos durante a época de estiagem.

Uma forma eficaz de controlar doenças nas folhas do eucalipto é através do uso de espécies tolerantes ou resistentes. A Eucalyptus grandis é considerada a espécie mais resistente entre as mais plantadas atualmente.

O fungo Ceratocystis fimbriata causa murchas e cancros no eucalipto ao colonizar o floema, o que leva à morte da planta devido ao colapso do sistema de transporte e impedimento do fluxo normal da seiva elaborada.