As variações entre volume da descarga fluvial e amplitude de marés, além de fatores como ondas e ventos, promovem modificações nos padrões de circulação estuarina permitindo a classificação dos estuários em: altamente estratificados ou de cunha salina, totalmente misturados e parcialmente estratificados ou parcialmente misturados. São características dos estuários altamente estratificados ou de cunha salina: