A parede celular reforça a membrana citoplasmática das bactérias, exclusivamente. São denominadas bactérias gram-negativas as que possuem parede celular mais complexa que as demais, as bactérias gram-positivas. Assim, a toxicidade seletiva dos antimicrobianos que inibem síntese de parede celular é grande, como nas penicilinas e cefalosporinas

As penicilinas atuam melhor em infecções crônicas, pois destroem a parede celular, mesmo quando a reprodução bacteriana é baixa

Os antibióticos que atuam na síntese proteica podem interferir na tradução da informação (inibição) ou formação de proteínas defeituosas. A tetraciclina faz parte do grupo que forma proteínas defeituosas e por isso nunca são indicadas em Odontologia

O metronidazol age na síntese de ácidos nucleicos, o que lhe confere uma ação bactericida, mas é ineficiente em bactérias anaeróbias, não sendo muito indicadas em Odontologia