Por essa atividade ser centralizada e ascendente, a farmácia é responsável por comprar os medicamentos por ordem alfabética.

A programação deve ser baseada na lista de medicamentos selecionados pelas indústrias farmacêuticas, considerando a posição atual dos estoques e o valor de custo do medicamento.

A farmácia remete ao serviço médico hospitalar a solicitação de medicamentos informando a demanda local e as quantidades disponíveis de cada medicamento na farmácia. Este, por sua vez, reúne as demandas de toda rede para realizar a programação dos medicamentos a adquirir para atender às necessidades da população.

Programar medicamentos consiste em estimar quantidades a serem adquiridas, para atender determinada demanda de serviços, em um período definido de tempo, possuindo influência direta sobre o abastecimento e o acesso ao medicamento.

Há várias formas de proceder a uma estimativa técnica das necessidades de uma farmácia, porém, o perfil de morbimortalidade é importante aspecto a se considerar. Pois dispõe de dados consistentes sobre o consumo de medicamentos das Unidades Básicas de Saúde, dos Hospitais e Clínicas médicas particulares para a dispensação segura de medicamentos.