O material coletado por punção não é adequado à cultura de microrganismos, cujo crescimento é inviabilizado pela pressão a que o material é submetido durante a aspiração.

A desinfecção com álcool 70% é suficiente para se preparar o material a ser utilizado para armazenamento do líquido coletado.

Após a coleta do material, o tubo deve ser esterilizado em chama de bico de Bunsen.

A coleta de material da cavidade pleural para bacterioscopia deve ser feita em seringa e tubo heparinizados, para que o sangue normalmente presente nesse espaço não prejudique a análise.

Uma das possíveis formas de se preparar o material a ser utilizado para a coleta é a esterilização por raios gama.