A estrutura de controle interno compreende ambiente de controle; mapeamento e avaliação de riscos; procedimentos de controle; informação e comunicação; e monitoramento. Este compreende a identificação dos eventos ou das condições que podem afetar a qualidade da informação contábil.

O controle interno classifica-se em patrimonial, contábil e normativo. Aquele é relacionado às ações que propiciam o alcance dos objetivos da entidade, esse, à veracidade e à fidedignidade dos registros e das demonstrações contábeis e este, à observância da regulamentação pertinente.

O controle interno sob o enfoque contábil compreende o conjunto de recursos, métodos, procedimentos e processos adotados pela entidade do setor público, sendo uma das suas finalidades estimular adesão às normas e às diretrizes fixadas.

O controle interno deve ser exercido em todos os níveis da entidade do setor público, compreendendo a preservação do patrimônio público e o controle da execução das ações que integram os programas.