Pacientes com doença pulmonar obstrutiva crônica (DPOC) e apneia obstrutiva do sono têm maior hipoxemia relacionada ao sono, mas, pela adaptação, não possuem maior tendência a hipertensão pulmonar e a cor pulmonale do que aqueles apenas com DPOC.

Em pacientes com asma brônquica e apneia obstrutiva do sono, um dos possíveis mecanismos fisiopatológicos de agravamento é o refluxo gastroesofágico com hiperreatividade das vias aéreas e inflamação brônquica.

Em pacientes com DPOC e apneia obstrutiva do sono, o tratamento com pressão positiva deverá sempre ser com BiPAP e nunca com CPAP, pelo risco de pneumotórax.

Em pacientes asmáticos com apneia obstrutiva do sono, é frequente a ocorrência de dessaturações mais graves, especialmente durante o sono não REM.