A autonomia confere aos municípios a total independência da União e do Estado correspondente, tornando-o livre para acatar ou não as disposições da Constituição Federal e Constituição Estadual.

A capacidade de autoadministração não é típica de municípios, mas apenas de Estados e da União.

Os municípios possuem, em face da autonomia, a capacidade de auto-organização, ou seja, assim como a União e os Estados, eles também podem se organizar por meio de Constituições Municipais, votada em dois turnos, com interstício mínimo de 10 dias e aprovada por dois terços dos membros da Câmara Municipal.

A autonomia municipal implica também na capacidade de autoadministração, por meio da qual os municípios podem organizar sua própria estrutura administrativa, sem depender de órgãos federais ou estaduais para autorizá-lo a cuidar dos interesses locais.