A avaliação institucional avalia a eficácia e a qualidade global da instituição de ensino, enquanto a avaliação do processo de ensino-aprendizagem foca especificamente no desenvolvimento dos alunos.

A avaliação institucional se concentra nos resultados finais dos alunos, enquanto a avaliação do processo de ensino-aprendizagem analisa o desempenho dos docentes.

A avaliação institucional é feita apenas uma vez por ano, enquanto a avaliação do processo de ensino-aprendizagem ocorre continuamente ao longo do ano letivo.

A avaliação institucional envolve apenas a análise de indicadores quantitativos, enquanto a avaliação do processo de ensino-aprendizagem considera também aspectos qualitativos.

A avaliação institucional é realizada pelos órgãos governamentais de educação, enquanto a avaliação do processo de ensino-aprendizagem é de responsabilidade da escola e dos professores.