Uma vantagem das vacinas de RNA em relação às vacinas tradicionais é a possibilidade de induzirem uma resposta imune mais rápida, já que o RNA mensageiro já contém o "molde" pronto para a produção do antígeno nas células hospedeiras.

As vacinas de DNA são preferíveis em relação às vacinas de RNA, pois não requerem a incorporação do material genético nas células hospedeiras para induzir a produção de antígenos.

As vacinas de RNA necessitam de uma etapa adicional em comparação às vacinas de DNA, pois o RNA precisa ser convertido em DNA antes de codificar o antígeno nas células do hospedeiro.

As vacinas de DNA utilizam o RNA mensageiro para transportar o "molde" genético do vírus diretamente para o núcleo das células, onde é transformado em antígeno.

As vacinas de DNA são mais seguras do que as vacinas de RNA, pois evitam completamente qualquer risco de reações imunes adversas, enquanto as vacinas de RNA podem gerar reações imunes significativas.