Basta isolar o elemento que sustenta o microscópio de força atômica do piso do laboratório por meio de tiras elásticas para eliminar a maior parte das fontes de ruídos que podem afetar a qualidade das imagens, desde que o ambiente seja silencioso e tenha a temperatura constante.

É necessário instalar o microscópio em uma câmara de alto vácuo para eliminar a maior parte dos ruídos que podem afetar a qualidade das imagens.

É necessário instalar o microscópio em um criostato em baixa temperatura para eliminar a maior parte dos ruídos que podem afetar a qualidade das imagens.

É necessário utilizar salas limpas especiais com isolamento acústico para eliminar a maior parte dos ruídos que podem afetar a qualidade das imagens.

A popularidade dos microscópios de força atômica deve-se a sua versatilidade e à sua robustez, pois eles podem ser instalados sobre uma bancada comum sem amortecimento sem que haja problemas com a qualidade da imagem obtida.