As microalgas compreendem diferentes grupos de eucariotos unicelulares que adquiriram a capacidade de realizar fotossíntese a partir de ancestrais envolvidos em eventos de endossimbiose primária com cianobactérias — como no caso das algas verdes e vermelhas — ou em eventos de endossimbiose secundária envolvendo algas verdes ou vermelhas. O clado que inclui os descendentes do ancestral que adquiriu plastídios por meio de endossimbiose secundária com uma alga vermelha é o clado