O monitoramento de pragas é dispensável para o MIP.

Como método químico de controle, há a solarização do solo.

O controle biológico de pragas é um método de controle exercido pelas plantas produzindo compostos de defesa.

Como método cultural, há a rotação de culturas que consiste em plantar, alternadamente, culturas que não sejam hospedeiras das mesmas pragas, de modo a quebrar ou interromper o ciclo de desenvolvimento das pragas.

A utilização de agrotóxicos é o único método de controle de pragas eficiente em grandes cultivos.