O tratamento secundário compreende a remoção de poluentes específicos por meio de procedimentos físico-químicos.

A remoção de particulados é feita pelo tratamento primário das águas residuais, por meio de procedimentos físicoquímicos.

A remoção de poluentes inorgânicos e metais pesados, por meio de processos como sedimentação, floculação ou decantação, ocorre no tratamento terciário.

O pré-tratamento consiste na remoção, por meio de reações bioquímicas, de matérias orgânicas desses efluentes.