Um pesquisador está utilizando a técnica de sequenciamento de Nova Geração (NGS) para investigar mutações em um conjunto de genes associados ao câncer. Durante a análise dos dados de sequenciamento, ele observou que uma alta proporção de leituras (reads) apresenta baixa qualidade e muitas das mutações identificadas não eram reprodutíveis em replicadas independentes.

Assinale a alternativa que oferece a melhor abordagem para resolver os problemas observados.