O Rio Negro possui águas mais ácidas do que as do Solimões.

As águas do Rio Solimões possuem maior quantidade de suspensão terrígena do que as do Rio Negro.

As áreas sazonalmente alagadas pelo Rio Solimões são mais férteis do que as áreas sazonalmente alagadas pelo Rio Negro.

No Rio Solimões há mais biomassa por unidade de volume do que no Rio Negro.

No Rio Solimões a produtividade primária é menor do que no Rio Negro.