O tratamento compreende uma fase inicial de ataque (ou de indução) com duração de 1 semana, seguido pela fase de consolidação completando 2 semanas de tratamento.

A anfoterecina B, tanto na forma de deoxicolato como na formulação liídica, é o principal fármaco da fase de ataque.

A anfoterecina B lipossomal está associada a menor agressão renal quando comparada à anfoterecina B deoxicolato.

Ao final de 2 semanas de tratamento, uma nova cultura do líquor deve ser coletada. Se houver persistência de fungos viáveis, o tratamento de ataque deve ser estendido.

A estratégia de tratamento da meningoencefalite criptocócica compreende uma fase inicial de ataque (ou de indução), fase de consolidação e período de manutenção.