Flagelos e cílios são idênticos estruturalmente, porém, são diferentes no comprimento, sendo o flagelo de tamanho maior. Diferem também em número e geralmente, cílios são mais numerosos.

Nos movimentos flagelares as ondas passam do ápice para a base como em chicote, movimentando o indivíduo na direção contrária.

Algumas espécies possuem mastigonemas (pelos laterais) nos flagelos.

Os cílios apresentam movimentos mais ágeis que os flagelos, e por meio de ondas metacronais, observa-se distúrbio da água causado por um cílio que estimula o batimento do cílio seguinte.

Os pseudópodos são projeções da parede celular de alguns protozoários como amebas, que podem ser reforçados por filamentos citoplasmáticos, sendo úteis também na captação de alimentos.