Com o passar das gerações, a partir da F₂, há um aumento expressivo da homozigose devido às autofecundações; assim, o tamanho das populações pode ser pequeno até a geração F₁₀, onde deve ser ampliado ao máximo para a realização de seleção.

As gerações F₂, obtidas de diferentes cruzamentos, devem ter o maior número de indivíduos possível para que o maior número de combinações alélicas possa se expressar; contudo, com o passar das gerações, esse número pode diminuir, pois há um aumento expressivo das combinações alélicas favoráveis.

As gerações F₂ devem ter pelo menos 250 indivíduos para não existam riscos de aumento da endogamia na população segregante.

A geração F₁ deve ter um grande número de indivíduos para que se expresse a maior variabilidade possível.

O número de indivíduos de populações segregantes, a partir da F₂, não deve diminuir com o passar das gerações, pois, apesar do aumento de homozigose e, portanto, redução do número total de genótipos, há uma baixa proporção de indivíduos com combinações específicas de alelos favoráveis.