As interrupções são bastante comuns na operação dos microcontroladores. Elas são provocadas de forma externa, desviando o endereço da sequência de instruções para um endereço especial e sem retorno para a sequência original no fim da interrupção.

O contador do programa armazena o endereço da instrução que será executada. Esse contador não pode ser zerado e a quantidade de instruções que se pode executar é limitada ao número de bits de operação.

A sequência de gravação das instruções na memória do programa não é relevante para a operação do microcontrolador, pois ele executa primeiro a instrução que tem o menor tempo de execução.

Uma interrupção pode ser provocada por temporizadores, watchdog timeout, interfaces de comunicações, barramentos e pinos digitais, por exemplo.

Não é possível expandir a memória de um microcontrolador, sendo viável apenas a substituição do dispositivo por um modelo de maior capacidade.