As zonas de transição dos biomas brasileiros, também conhecidas como ecótonos, são as regiões resultantes do contato entre dois ou mais biomas limítrofes. Dessa forma, nessas áreas de transição ambiental, diferentes comunidades ecológicas ou biomas entram em contato, adquirindo características específicas a partir dessa junção entre fauna e flora. São consideradas zonas de transição dos biomas brasileiros: