Duas das principais desvantagens da departamentalização por produtos ou serviços são a possibilidade de criar uma situação em que os gestores de produtos ou serviços se tornem muito poderosos, o que pode desestabilizar a estrutura da organização, além do fato de que tal tipo de departamentalização pode provocar problemas humanos de temores e ansiedades, quando em situação de instabilidade externa, pois os colaboradores tendem a ser mais inseguros com relação a alguma possibilidade de desemprego ou retardamento em sua carreira profissional.